В четырехсотом году до нашей эры Китай еще не был единым государством. Многочисленные княжества вели между собой постоянные воины, в которых гибли тысячи людей, даже не понимающих под чьими знаменами и за что они сражаются. Огромное войско династии Чжао, в котором насчитывалось более ста тысяч воинов, движется на крохотное княжество Лианг, все население которого насчитывает около четырех тысяч человек. Чтобы защитить свое княжество князь Лианга решает нанять Ге Ли, монаха из ордена Мо-Ци. Человека, прославившегося как прекрасный полководец.

В 1614 году вся Япония объединяется под знаменем нового правителя Сегуна Такугавы. Одним из источников возможных столкновений за власть он видит две деревни Кога и Ига. Там на протяжении четырехсот лет живут ниндзя, мастерство убивать которых доведено до совершенства. Они прирожденные воины и сравниться с ними не может никто во всей империи. Такугава решает разжечь войну между этими деревнями. Он обещает, что следующий правитель Японии будет принадлежать деревне, которая одержит победу над своим противником.

Роскошная красавица с красивым именем Шейла, приглашает в свой дом Саи, который является жертвой её чар. Наговорила бедному парню, что они созданы друг для друга, приплела сюда какие-то знаки судьбы и прочие глупые чудеса... Но на самом деле у Шейлы был план - совсем недавно она рассталась со своим покровителем - главарем якудзы, кинув его на хорошие бабки, и теперь собирается подставить влюбленного дурочка Саи, чтобы, элементарно, смыться... Однако обстоятельства сложились так, что смываться им придется вдвоем...

Двенадцатый фильм о гигантской огнедышащей черепахе, защитнице Земли.
Несколько лет прошло с тех пор, как Гамера ценой своей жизни отразила нападение стаи крылатых монстров. На Земле пока все спокойно, но это спокойствие напоминает затишье перед бурей.
Тем временем оставшийся без матери маленький Торо находит в лесу новорожденную черепашку и берет к себе домой. Однако черепашка растет не по дням, а по часам, начинает проявлять сверхъестественные способности, и вскоре становится ясно, что это новое воплощение Гамеры. Она появилась как раз вовремя - на город, где живет Торо, нападает гигантский монстр Зедус...