В 17 веке в стране восходящего солнца правит сегунат Токугава, который является ярым противником христианства. По его требованию, наложен запрет на христианское вероисповедание. Стоящие у власти нацелены оградить государство от влияния чуждой религии. Повсеместно устраиваются гонения на японских христиан. Несмотря на это, два священника отправляются странствовать по закрытой для иностранцев Японии, проповедуя христианство, а также в поисках наставника. Монахи наблюдают неисчислимые страдания своих единоверцев и в то же время находят способы тайно проповедовать веру. Пробираясь все дальше в глубь страны, священники пытаются найти ответ на вопрос, который так сильно мучает единомышленников: «Почему Бог молчит, в то время, когда дети страдают и умирают в муках?». Удастся ли героям найти в себе силы не усомниться в собственной вере?

До начала Великой отечественной войны христианство подвергалось гонениям на территории Советского Союза. После того как северо-запад Советского Союза оказался в руках фашистов, там началось возрождение христианских традиций. Действия фильма разворачиваются в Псковской православной миссии. Прибалтийские священники-миссионеры три года вели здесь свою деятельность, до тех пор, пока советские войска не освободили захваченную фашистами территорию. После того как фашисты покинули территорию Псковской области, священники были сосланы в лагеря.

Бен Карсон рос в бедной семье, своего отца Бен не помнил, его воспитанием занималась только мать. В школе у маленького Бена были далеко не самые лучшие оценки, но мать всегда верила в своего сына. У мальчика была мечта – стать хирургом, и, не смотря ни на что, он решил двигаться к своей цели. Вера матери в Бена передалась ему самому, и он шел к своей цели, преодолевая все преграды, возникающие на пути. В итоге он смог стать выдающимся нейрохирургом. Карсон вошел в историю медицины, как человек впервые сделавший операцию по разделению сиамских близнецов, сросшихся головами.