Не успели люди опомниться и прийти в себя после последнего сражения монстров, как человечеству снова угрожает смертельная опасность в лице несколько ужасных чудовищ. На этот раз человечеству предстоит сразиться с драконом Гидра, огромной бабочкой Мотра и птирозавром Родоном. Неудачные эксперименты учёных с созданием смертоносного оружия привели к тому, что человечеству вновь придётся сражаться за своё выживание. Правда, спастись люди могут только благодаря криптозоологическому агентству «Монарх». В противовес монстрам встал огромный ящер Годзилла, который всё это время обитал в океане. В жестокой схватке между огромными чудовищами человечеству остаётся только спрятаться куда поглубже.

Величайший детектив и сыщик Гарри Гудман куда-то пропал. Его поисками займётся 21-летний сын Тим, которому в своё время Гарри передал большую часть своих знаний и навыков. Так как Тим только начинающий сыщик, его помощником выступит партнёр отца детектив Пикачу. Он полная противоположность Гарри – остроумный, уморительный и безумно обаятельный. Вместе им предстоит пройти немалое количество испытаний и опасностей, прежде чем они найдут ответы на все вопросы. Им предстоит путешествие в удивительном игровом мире, где современная реальность бьется бок о бок с гиперреализмом. Где вместе с людьми по улицам бродят покемоны. А ещё им предстоит раскрыть страшный заговор, который может уничтожить всю вселенную.

Собравшись провести отпуск на морском побережье, семейная пара вместе со своими детьми и друзьями отправляется в симпатичный пляжный домик. В этом уютном и живописным месте они рассчитывали как следует отдохнуть и расслабиться. Но их мечтам не суждено осуществиться, и с наступлением темноты вокруг домика начали происходить очень странные явления. Вскоре стало понятно, что это как-то связано с загадочными и мрачными соседями, появившимися непонятно откуда и молчаливо смотрящими на них. Долгожданный отдых, начинавшийся так хорошо, вскоре превратится в настоящий кровавый кошмар...

События начинают происходить в стране, носящей дивное название Аместрис. Здесь действительно есть место волшебству, так как алхимия для этой страны не профанация, а точная наука. Здесь живут братья Эдвард и Альфонс. Они достигли подросткового возраста и уже имели кое-какое представление об алхимии, но слишком поверхностные. С помощью науки они применили попытку воскресить свою умершую мать. Им дорого стоила эта выходка. Один брат лишился ноги и руки, а у второго и вовсе все тело пропало, но его заменили рыцарские доспехи. Вдвоем пострадавшие от незнания братья отправились в столицу, чтобы постигать алхимические тонкости.

К 2029 году, благодаря повсеместно распространившимся компьютерным сетям и кибер-технологиям, практически все люди вживили себе разнообразные нейронные имплантаты. Но кибер-технологии принесли и новую опасность для человека: стал возможным так называемый «взлом мозга» и ряд других преступлений, связанный непосредственно с ними.

Пять обычных старшеклассников узнают, что их маленький город Энджел Гроув и весь мир находятся на грани того, чтобы быть уничтоженными инопланетной угрозой. Избранные судьбой, наши герои быстро понимают, что они единственные, кто может спасти планету.

Действия фильма разворачиваются с того момента, на котором закончилась предыдущая часть. После того как Вескер предал Элис в Вашингтоне, конец истории человечества стал еще ближе. Элис — последняя надежда на спасение мира. Она должна вернуться к точке отсчета, туда, где все и началось — город Раккун-Сити, где корпорация «Амбрелла» готовится к финальной атаке по тем, кому удалось выжить.

Веками неприступные стены Штормграда и магия защищали людей от любых напастей. Но древнее зло, побежденное и забытое тысячелетия назад, пробудилось.